El logo de la Universidad Cristiana Teológica (UCTE), es de color azul monocromático (1a548d) El color azur que simboliza entre las piedras preciosas al zafiro, es símbolo de majestad, hermosura, serenidad y justicia. El logo existe en modalidad larga (con textos al lado) y en modalidad corta (sin textos, solo abreviación UCTE). En su modalidad completa larga, el logo posee la abreviación UCTE que significa Universidad Cristiana Teológica. Al lado se lee en letra azul (AvantGarde-Book Bold 1a548d) Universidad Cristiana Teológica. Debajo con la misma tipografía se lee parte del Salmo 25:5, “Encamíname en tu verdad, ¡enséñame! (Nueva Versión Internacional). Entre la abreviación y las palabras existe una línea divisoria vertical de color azul. Dentro de la abreviación se encuentran varios elementos entremezclados. Sobre la U un birrete que es propiamente representativo de la educación, la T representa la cruz de nuestro Señor Jesucristo y debajo de ella se encuentra la Santa Biblia que es su palabra. Sobre la cruz se visualiza una paloma que representa el Espíritu Santo.

El escudo de la Universidad Cristiana Teológica (UCTE) se utiliza como el elemento de más alta distinción y prestigio de la Universidad. Este se presenta en dos derivaciones. Una de ellas ubica palabras bajo el escudo mientras la otra imagen no. El logotipo es de color rojo oscuro (820024). Posee bajo éste la Palabra UNIVERSIDAD CRISTIANA TEOLÓGICA (Bell MT Regular) y debajo de esta palabra se lee la palabra en idioma latín DOMINUS DAT SAPIENTIAM en una letra de menor puntuación y que significa Jehová da la Sabiduría (Proverbios 2:6); ambas palabras están escritas en su totalidad en letras mayúsculas. Arriba alineado en el centro del logo aparece la palabra Since 2019 que es el año que nace la universidad. El centro del logotipo es un escudo el cual hereda su código de los históricos escudos de armas como un elemento defensivo que en este caso para la UCTE la educación en la palabra de Dios representa el escudo de la fe (Efesios 6:16). Sobre el escudo aparece una banda (ribbon) que lleva la palabra Since 2019. Bajo la banda, aparece en el centro una figura de un león representativa del león de la tribu de Judá que ha vencido (Apocalipsis 5.5). El escudo es dividido en cuatro partes (cuartelado). En el centro de estas cuatro partes ubica la figura de una antorcha de madera encendida que representa la lámpara del mandamiento y la luz de la enseñanza (proverbios 6:23). Tanto la división superior izquierda e inferior derecha tiene como fondo el color blanco que representa las vestiduras de los ejércitos celestiales (Apocalipsis 19:14). Mientras que la división superior derecha e inferior izquierda su fondo es de color rojo, color de las vestiduras en el regreso del Señor (Apocalipsis 19:13). El color rojo representa también la sangre del Señor que nos limpia de todo pecado (1 Juan 1:7). En el recuadro superior izquierdo ubica una figura de una arroba con un birrete colocado que representa la educación en línea (online). El cuadro superior derecho muestra en su centro la imagen de un ángel con una gran espada que representa la protección divina del ángel de Jehová. En el cuadro inferior izquierdo se muestra la imagen de un libro que representa la Santa Biblia que es la palabra de Dios. Finalmente, en el recuadro inferior derecho se muestran dos líneas diagonales hacia la derecha que representan movimiento, son dinámicas y parecen progresar como los estudiantes de la universidad.

Bandera de color blanco y en su centro el escudo de la universidad. Además de dignidad académica significa acción y revolución constante y perenne en busca de la verdad de Dios.